对APEO的环境影响评估一般主要看其急性毒性、对水生物的降解性、致畸和致癌性、对皮肤的刺激性、环境激素问题等。APEO中NPEO的LD50显示对鱼类的毒性很大，接近强毒性，在这一点上虽然对人类的直接毒性很小，但毒性在第一级生物体内累积，在更高一级的物体内被放大到更高的数量级，从整个食物链来看，其对人类的毒性是间接的。

APEO因疏水碳链含有苯环结构，与阴离子和其它非离子表面活性剂比较，其生物降解性是较差的，如NPEO9最初的生物降解性4%～80%，NPEO20的最初降解性为4%～40%，而欧盟要求环保型表面活性剂的最初降解率必须在80%以上。另外，APEO中的NPEO在降解过程中可能形成NP，这些对鱼、无脊椎动物、海藻类、微生物具有高毒性。

APEO本身不具有致畸和致癌性，但其合成的副产物却可能有致癌性，如反应物之一的环氧乙烷的二聚产物1,4－二噁烷被证实为致癌物质，而现在这个问题可以通过控制和选用合适的反应设备和控制反应条件来解决。

APEO的环境激素问题也引起了人们的广泛关注，环境激素是指化学物质可以通过各种途径侵入人体，具有类似于雌性激素的作用，危害人体正常的激素分泌的化学物质，导致男性精子数量减少。NP和OP已经被美国环境保护署列进70种环境激素化学物质清单中。而现在有研究和报道说，NPEO也有类似于NP的激素效应。